La Asamblea General es el máximo órgano de representación del Comité Español de Ciencias Históricas. Está formada por los delegados de todas las entidades asociadas.

Todas las entidades que integran el Comité Español de Ciencias Históricas pueden designar dos delegados para la Asamblea. Asimismo pueden designar delegados suplentes, que solo tendrán voz y voto en ausencia del delegado titular. Un delegado puede representar a otro delegado, en este caso con doble voto.

La Asamblea se reúne al menos una vez al año. En su reunión anual ordinaria, es informada sobre las actividades desarrolladas por el Comité Español a lo largo del año anterior y sobre los acuerdos del Comité Internacional. Asimismo examina y aprueba las cuentas que presente el Tesorero y los presupuestos anuales, elige los miembros de la Junta Directiva y delibera sobre todas las cuestiones que ésta le someta.